source: trunk/pbs_drmaa/session.c @ 7

Revision 7, 13.6 KB checked in by mmamonski, 9 years ago (diff)

lost updates...

Line 
1/* $Id: session.c 385 2011-01-04 18:24:05Z mamonski $ */
2/*
3 *  FedStage DRMAA for PBS Pro
4 *  Copyright (C) 2006-2009  FedStage Systems
5 *
6 *  This program is free software: you can redistribute it and/or modify
7 *  it under the terms of the GNU General Public License as published by
8 *  the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
9 *  (at your option) any later version.
10 *
11 *  This program is distributed in the hope that it will be useful,
12 *  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
13 *  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
14 *  GNU General Public License for more details.
15 *
16 *  You should have received a copy of the GNU General Public License
17 *  along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
18 */
19
20#ifdef HAVE_CONFIG_H
21#       include <config.h>
22#endif
23
24#include <stdlib.h>
25#include <string.h>
26#include <unistd.h>
27#include <sys/select.h>
28#include <sys/stat.h>
29#include <sys/types.h>
30#include <fcntl.h>
31
32#include <pbs_ifl.h>
33#include <pbs_error.h>
34
35#include <drmaa_utils/datetime.h>
36#include <drmaa_utils/drmaa.h>
37#include <drmaa_utils/iter.h>
38#include <drmaa_utils/conf.h>
39#include <drmaa_utils/session.h>
40#include <drmaa_utils/datetime.h>
41
42#include <pbs_drmaa/job.h>
43#include <pbs_drmaa/log_reader.h>
44#include <pbs_drmaa/session.h>
45#include <pbs_drmaa/submit.h>
46#include <pbs_drmaa/util.h>
47
48#include <errno.h>
49
50#ifndef lint
51static char rcsid[]
52#       ifdef __GNUC__
53                __attribute__ ((unused))
54#       endif
55        = "$Id: session.c 385 2011-01-04 18:24:05Z mamonski $";
56#endif
57
58static void
59pbsdrmaa_session_destroy( fsd_drmaa_session_t *self );
60
61static void
62pbsdrmaa_session_apply_configuration( fsd_drmaa_session_t *self );
63
64static fsd_job_t *
65pbsdrmaa_session_new_job( fsd_drmaa_session_t *self, const char *job_id );
66
67static bool
68pbsdrmaa_session_do_drm_keeps_completed_jobs( pbsdrmaa_session_t *self );
69
70static void
71pbsdrmaa_session_update_all_jobs_status( fsd_drmaa_session_t *self );
72
73static void
74*pbsdrmaa_session_wait_thread( fsd_drmaa_session_t *self );
75
76static char *
77pbsdrmaa_session_run_impl(
78                fsd_drmaa_session_t *self,
79                const fsd_template_t *jt,
80                int bulk_idx
81                );
82
83static struct attrl *
84pbsdrmaa_create_status_attrl(void);
85
86
87fsd_drmaa_session_t *
88pbsdrmaa_session_new( const char *contact )
89{
90        pbsdrmaa_session_t *volatile self = NULL;
91
92        if( contact == NULL )
93                contact = "";
94        TRY
95         {
96                self = (pbsdrmaa_session_t*)fsd_drmaa_session_new(contact);
97                fsd_realloc( self, 1, pbsdrmaa_session_t );
98                self->super_wait_thread = NULL;
99
100                self->log_file_initial_size = 0;
101                self->pbs_conn = -1;
102                self->pbs_home = NULL;
103
104                self->wait_thread_log = false;
105                self->status_attrl = NULL;
106               
107                self->super_destroy = self->super.destroy;
108                self->super.destroy = pbsdrmaa_session_destroy;
109                self->super.new_job = pbsdrmaa_session_new_job;
110                self->super.update_all_jobs_status
111                                = pbsdrmaa_session_update_all_jobs_status;
112                self->super.run_impl = pbsdrmaa_session_run_impl;
113
114                self->super_apply_configuration = self->super.apply_configuration;
115                self->super.apply_configuration = pbsdrmaa_session_apply_configuration;
116
117                self->do_drm_keeps_completed_jobs =
118                        pbsdrmaa_session_do_drm_keeps_completed_jobs;
119
120                self->status_attrl = pbsdrmaa_create_status_attrl();
121
122                self->pbs_conn = pbs_connect( self->super.contact );
123                fsd_log_debug(( "pbs_connect(%s) =%d", self->super.contact,
124                                        self->pbs_conn ));
125                if( self->pbs_conn < 0 )
126                        pbsdrmaa_exc_raise_pbs( "pbs_connect" );
127
128                self->super.load_configuration( &self->super, "pbs_drmaa" );
129
130                self->super.missing_jobs = FSD_IGNORE_MISSING_JOBS;
131                if( self->do_drm_keeps_completed_jobs( self ) )
132                        self->super.missing_jobs = FSD_IGNORE_QUEUED_MISSING_JOBS;
133         }
134        EXCEPT_DEFAULT
135         {
136                if( self )
137                  {
138                        self->super.destroy( &self->super );
139                        self = NULL;
140                  }
141         }
142        END_TRY
143        return (fsd_drmaa_session_t*)self;
144}
145
146
147void
148pbsdrmaa_session_destroy( fsd_drmaa_session_t *self )
149{
150        pbsdrmaa_session_t *pbsself = (pbsdrmaa_session_t*)self;
151        self->stop_wait_thread( self );
152        if( pbsself->pbs_conn >= 0 )
153                pbs_disconnect( pbsself->pbs_conn );
154        fsd_free( pbsself->status_attrl );
155        pbsself->super_destroy( self );
156}
157
158
159static char *
160pbsdrmaa_session_run_impl(
161                fsd_drmaa_session_t *self,
162                const fsd_template_t *jt,
163                int bulk_idx
164                )
165{
166        char *volatile job_id = NULL;
167        fsd_job_t *volatile job = NULL;
168        pbsdrmaa_submit_t *volatile submit = NULL;
169
170        fsd_log_enter(( "(jt=%p, bulk_idx=%d)", (void*)jt, bulk_idx ));
171        TRY
172         {
173                submit = pbsdrmaa_submit_new( self, jt, bulk_idx );
174                submit->eval( submit );
175                job_id = submit->submit( submit );
176                job = self->new_job( self, job_id );
177                job->submit_time = time(NULL);
178                job->flags |= FSD_JOB_CURRENT_SESSION;
179                self->jobs->add( self->jobs, job );
180                job->release( job );  job = NULL;
181         }
182        EXCEPT_DEFAULT
183         {
184                fsd_free( job_id );
185                fsd_exc_reraise();
186         }
187        FINALLY
188         {
189                if( submit )
190                        submit->destroy( submit );
191                if( job )
192                        job->release( job );
193         }
194        END_TRY
195        fsd_log_return(( " =%s", job_id ));
196        return job_id;
197}
198
199
200static fsd_job_t *
201pbsdrmaa_session_new_job( fsd_drmaa_session_t *self, const char *job_id )
202{
203        fsd_job_t *job;
204        job = pbsdrmaa_job_new( fsd_strdup(job_id) );
205        job->session = self;
206        return job;
207}
208
209void
210pbsdrmaa_session_apply_configuration( fsd_drmaa_session_t *self )
211{
212        pbsdrmaa_session_t *pbsself = (pbsdrmaa_session_t*)self;
213        fsd_conf_option_t *pbs_home;
214        pbs_home = fsd_conf_dict_get(self->configuration, "pbs_home" );
215        if( pbs_home )
216         {
217                if( pbs_home->type == FSD_CONF_STRING )
218                 {
219                        struct stat statbuf;
220                        char * volatile log_path;
221                        struct tm tm;
222                       
223                        pbsself->pbs_home = pbs_home->val.string;
224                        fsd_log_debug(("pbs_home: %s",pbsself->pbs_home));
225                        pbsself->super_wait_thread = pbsself->super.wait_thread;
226                        pbsself->super.wait_thread = pbsdrmaa_session_wait_thread;             
227                        pbsself->wait_thread_log = true;
228       
229                        time(&pbsself->log_file_initial_time); 
230                        localtime_r(&pbsself->log_file_initial_time,&tm);
231
232                        if((log_path = fsd_asprintf("%s/server_logs/%04d%02d%02d",
233                                pbsself->pbs_home,       
234                                tm.tm_year + 1900,
235                                tm.tm_mon + 1,
236                                        tm.tm_mday)) == NULL) {
237                                fsd_exc_raise_fmt(FSD_ERRNO_INTERNAL_ERROR,"WT - Memory allocation wasn't possible");
238                        }
239
240                        if(stat(log_path,&statbuf) == -1) {
241                                char errbuf[256] = "InternalError";
242                                (void)strerror_r(errno, errbuf, 256);
243                                fsd_exc_raise_fmt(FSD_ERRNO_INTERNAL_ERROR,"stat error: %s",errbuf);
244                        }
245       
246                        fsd_log_debug(("Log file %s size %d",log_path,(int) statbuf.st_size));
247                        pbsself->log_file_initial_size = statbuf.st_size;
248                        fsd_free(log_path);
249                 }
250                else
251                {
252                        pbsself->super.enable_wait_thread = false;
253                        pbsself->wait_thread_log = false;
254                        fsd_log_debug(("pbs_home not configured. Running standard wait_thread (pooling)."));
255                }
256         }
257
258
259
260        pbsself->super_apply_configuration(self); /* call method from the superclass */
261}
262
263
264void
265pbsdrmaa_session_update_all_jobs_status( fsd_drmaa_session_t *self )
266{
267        volatile bool conn_lock = false;
268        volatile bool jobs_lock = false;
269        pbsdrmaa_session_t *pbsself = (pbsdrmaa_session_t*)self;
270        fsd_job_set_t *jobs = self->jobs;
271        struct batch_status *volatile status = NULL;
272
273        fsd_log_enter((""));
274
275        TRY
276         {
277                conn_lock = fsd_mutex_lock( &self->drm_connection_mutex );
278retry:
279
280#ifdef PBS_PROFESSIONAL
281                status = pbs_statjob( pbsself->pbs_conn, NULL, NULL, NULL );
282#else
283                status = pbs_statjob( pbsself->pbs_conn, NULL, pbsself->status_attrl, NULL );
284#endif
285                fsd_log_debug(( "pbs_statjob( fd=%d, job_id=NULL, attribs={...} ) =%p",
286                                 pbsself->pbs_conn, (void*)status ));
287                if( status == NULL  &&  pbs_errno != 0 )
288                 {
289                        if (pbs_errno == PBSE_PROTOCOL || pbs_errno == PBSE_EXPIRED)
290                         {
291                                if ( pbsself->pbs_conn >= 0)
292                                        pbs_disconnect( pbsself->pbs_conn );
293                                sleep(1);
294                                pbsself->pbs_conn = pbs_connect( pbsself->super.contact );
295                                if( pbsself->pbs_conn < 0 )
296                                        pbsdrmaa_exc_raise_pbs( "pbs_connect" );
297                                else
298                                        goto retry;
299                         }
300                        else
301                         {
302                                pbsdrmaa_exc_raise_pbs( "pbs_statjob" );
303                         }
304                 }
305                conn_lock = fsd_mutex_unlock( &self->drm_connection_mutex );
306
307                 {
308                        size_t i;
309                        fsd_job_t *job;
310                        jobs_lock = fsd_mutex_lock( &jobs->mutex );
311                        for( i = 0;  i < jobs->tab_size;  i++ )
312                                for( job = jobs->tab[i];  job != NULL;  job = job->next )
313                                 {
314                                        fsd_mutex_lock( &job->mutex );
315                                        job->flags |= FSD_JOB_MISSING;
316                                        fsd_mutex_unlock( &job->mutex );
317                                 }
318                        jobs_lock = fsd_mutex_unlock( &jobs->mutex );
319                 }
320
321                 {
322                        struct batch_status *volatile i;
323                        for( i = status;  i != NULL;  i = i->next )
324                         {
325                                fsd_job_t *job = NULL;
326                                fsd_log_debug(( "job_id=%s", i->name ));
327                                job = self->get_job( self, i->name );
328                                if( job != NULL )
329                                 {
330                                        job->flags &= ~FSD_JOB_MISSING;
331                                        TRY
332                                         {
333                                                ((pbsdrmaa_job_t*)job)->update( job, i );
334                                         }
335                                        FINALLY
336                                         {
337                                                job->release( job );
338                                         }
339                                        END_TRY
340                                 }
341                         }
342                 }
343
344                 {
345                        size_t volatile i;
346                        fsd_job_t *volatile job;
347                        jobs_lock = fsd_mutex_lock( &jobs->mutex );
348                        for( i = 0;  i < jobs->tab_size;  i++ )
349                                for( job = jobs->tab[i];  job != NULL;  job = job->next )
350                                 {
351                                        fsd_mutex_lock( &job->mutex );
352                                        TRY
353                                         {
354                                                if( job->flags & FSD_JOB_MISSING )
355                                                        job->on_missing( job );
356                                         }
357                                        FINALLY{ fsd_mutex_unlock( &job->mutex ); }
358                                        END_TRY
359                                 }
360                        jobs_lock = fsd_mutex_unlock( &jobs->mutex );
361                 }
362         }
363        FINALLY
364         {
365                if( status != NULL )
366                        pbs_statfree( status );
367                if( conn_lock )
368                        conn_lock = fsd_mutex_unlock( &self->drm_connection_mutex );
369                if( jobs_lock )
370                        jobs_lock = fsd_mutex_unlock( &jobs->mutex );
371         }
372        END_TRY
373
374        fsd_log_return((""));
375}
376
377
378
379struct attrl *
380pbsdrmaa_create_status_attrl(void)
381{
382        struct attrl *result = NULL;
383        struct attrl *i;
384        const int max_attribs = 16;
385        int n_attribs;
386        int j = 0;
387
388        fsd_log_enter((""));
389        fsd_calloc( result, max_attribs, struct attrl );
390        result[j++].name="job_state";
391        result[j++].name="exit_status";
392        result[j++].name="resources_used";
393        result[j++].name="ctime";
394        result[j++].name="mtime";
395        result[j++].name="qtime";
396        result[j++].name="etime";
397
398        result[j++].name="queue";
399        result[j++].name="Account_Name";
400        result[j++].name="exec_host";
401        result[j++].name="start_time";
402        result[j++].name="mtime";
403#if 0
404        result[j].name="resources_used";  result[j].resource="walltime";  j++;
405        result[j].name="resources_used";  result[j].resource="cput";  j++;
406        result[j].name="resources_used";  result[j].resource="mem";  j++;
407        result[j].name="resources_used";  result[j].resource="vmem";  j++;
408        result[j].name="Resource_List";  result[j].resource="walltime";  j++;
409        result[j].name="Resource_List";  result[j].resource="cput";  j++;
410        result[j].name="Resource_List";  result[j].resource="mem";  j++;
411        result[j].name="Resource_List";  result[j].resource="vmem";  j++;
412#endif
413        n_attribs = j;
414        for( i = result;  true;  i++ )
415                if( i+1 < result + n_attribs )
416                        i->next = i+1;
417                else
418                 {
419                        i->next = NULL;
420                        break;
421                 }
422
423#ifdef DEBUGGING
424        fsd_log_return((":"));
425        pbsdrmaa_dump_attrl( result, NULL );
426#endif
427        return result;
428}
429
430
431bool
432pbsdrmaa_session_do_drm_keeps_completed_jobs( pbsdrmaa_session_t *self )
433{
434
435#ifndef PBS_PROFESSIONAL
436        struct attrl default_queue_query;
437        struct attrl keep_completed_query;
438        struct batch_status *default_queue_result = NULL;
439        struct batch_status *keep_completed_result = NULL;
440        const char *default_queue = NULL;
441        const char *keep_completed = NULL;
442        volatile bool result = false;
443        volatile bool conn_lock = false;
444
445        TRY
446         {
447                default_queue_query.next = NULL;
448                default_queue_query.name = "default_queue";
449                default_queue_query.resource = NULL;
450                default_queue_query.value = NULL;
451                keep_completed_query.next = NULL;
452                keep_completed_query.name = "keep_completed";
453                keep_completed_query.resource = NULL;
454                keep_completed_query.value = NULL;
455
456                conn_lock = fsd_mutex_lock( &self->super.drm_connection_mutex );
457
458                default_queue_result =
459                                pbs_statserver( self->pbs_conn, &default_queue_query, NULL );
460                if( default_queue_result == NULL )
461                        pbsdrmaa_exc_raise_pbs( "pbs_statserver" );
462                if( default_queue_result->attribs
463                                &&  !strcmp( default_queue_result->attribs->name,
464                                        "default_queue" ) )
465                        default_queue = default_queue_result->attribs->value;
466
467                fsd_log_debug(( "default_queue: %s", default_queue ));
468
469                if( default_queue )
470                 {
471                        keep_completed_result = pbs_statque( self->pbs_conn,
472                                        (char*)default_queue, &keep_completed_query, NULL );
473                        if( keep_completed_result == NULL )
474                                pbsdrmaa_exc_raise_pbs( "pbs_statque" );
475                        if( keep_completed_result->attribs
476                                        &&  !strcmp( keep_completed_result->attribs->name,
477                                                "keep_completed" ) )
478                                keep_completed = keep_completed_result->attribs->value;
479                 }
480
481                fsd_log_debug(( "keep_completed: %s", keep_completed ));
482         }
483        EXCEPT_DEFAULT
484         {
485                const fsd_exc_t *e = fsd_exc_get();
486                fsd_log_warning(( "PBS server seems not to keep completed jobs\n"
487                                "detail: %s", e->message(e) ));
488                result = false;
489         }
490        ELSE
491         {
492                result = false;
493                if( default_queue == NULL )
494                        fsd_log_warning(( "no default queue set on PBS server" ));
495                else if( keep_completed == NULL && self->pbs_home == NULL )
496                        fsd_log_warning(( "PBS server is not configured to keep completed jobs\n"
497                                                "in Torque: set keep_completed parameter of default queue\n"
498                                                "  $ qmgr -c 'set queue batch keep_completed = 60'\n"
499                                                " or configure DRMAA to utilize log files"
500                                                ));
501                else
502                        result = true;
503         }
504        FINALLY
505         {
506                if( default_queue_result )
507                        pbs_statfree( default_queue_result );
508                if( keep_completed_result )
509                        pbs_statfree( keep_completed_result );
510                if( conn_lock )
511                        conn_lock = fsd_mutex_unlock( &self->super.drm_connection_mutex );
512
513         }
514        END_TRY
515#endif
516        return false;
517}
518
519void *
520pbsdrmaa_session_wait_thread( fsd_drmaa_session_t *self )
521{
522        pbsdrmaa_log_reader_t *log_reader = NULL;
523       
524        fsd_log_enter(( "" ));
525       
526        TRY
527        {       
528                log_reader = pbsdrmaa_log_reader_new( self, NULL);
529                log_reader->read_log( log_reader );
530        }
531        FINALLY
532        {
533                pbsdrmaa_log_reader_destroy( log_reader );
534        }
535        END_TRY
536       
537        fsd_log_return(( " =NULL" ));
538        return NULL;
539}
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.