source: trunk/pbs_drmaa/job.c @ 68

Revision 68, 16.1 KB checked in by mmamonski, 11 years ago (diff)

Ifdef on old error codes

  • Property svn:keywords set to Id
Line 
1/* $Id$ */
2/*
3 *  FedStage DRMAA for PBS Pro
4 *  Copyright (C) 2006-2009  FedStage Systems
5 *
6 *  This program is free software: you can redistribute it and/or modify
7 *  it under the terms of the GNU General Public License as published by
8 *  the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
9 *  (at your option) any later version.
10 *
11 *  This program is distributed in the hope that it will be useful,
12 *  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
13 *  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
14 *  GNU General Public License for more details.
15 *
16 *  You should have received a copy of the GNU General Public License
17 *  along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
18 */
19
20#ifdef HAVE_CONFIG_H
21#       include <config.h>
22#endif
23
24#include <signal.h>
25#include <stdlib.h>
26#include <string.h>
27#include <unistd.h>
28#include <sys/stat.h>
29
30#include <drmaa_utils/drmaa.h>
31#include <drmaa_utils/drmaa_util.h>
32#include <pbs_error.h>
33#include <pbs_ifl.h>
34
35#include <pbs_drmaa/job.h>
36#include <pbs_drmaa/log_reader.h>
37#include <pbs_drmaa/pbs_attrib.h>
38#include <pbs_drmaa/session.h>
39#include <pbs_drmaa/util.h>
40
41#ifndef lint
42static char rcsid[]
43#       ifdef __GNUC__
44                __attribute__ ((unused))
45#       endif
46        = "$Id$";
47#endif
48
49
50static void pbsdrmaa_job_control( fsd_job_t *self, int action );
51
52static void pbsdrmaa_job_update_status( fsd_job_t *self );
53
54static void pbsdrmaa_job_on_missing( fsd_job_t *self );
55
56static void pbsdrmaa_job_on_missing_standard( fsd_job_t *self );
57
58static void pbsdrmaa_job_update( fsd_job_t *self, struct batch_status* );
59
60static int pbsdrmaa_job_read_exit_status( const char *job_id, const char *job_state_dir_prefix);
61
62fsd_job_t *
63pbsdrmaa_job_new( char *job_id )
64{
65        pbsdrmaa_job_t *self = (pbsdrmaa_job_t*)fsd_job_new( job_id );
66        fsd_realloc( self, 1, pbsdrmaa_job_t );
67        self->super.control = pbsdrmaa_job_control;
68        self->super.update_status = pbsdrmaa_job_update_status;
69        self->super.on_missing = pbsdrmaa_job_on_missing;
70        self->missing_time = 0;
71        self->update = pbsdrmaa_job_update;
72        return (fsd_job_t*)self;
73}
74
75
76static void
77pbsdrmaa_job_control( fsd_job_t *self, int action )
78{
79        volatile bool conn_lock = false;
80        pbsdrmaa_session_t *session = (pbsdrmaa_session_t*)self->session;
81        const char *job_id = self->job_id;
82        const char *apicall = NULL;
83        int rc = PBSE_NONE;
84
85        fsd_log_enter(( "({job_id=%s}, action=%d)",
86                        self->job_id, action ));
87
88        TRY
89         {
90                int tries_left = session->max_retries_count;
91                int sleep_time = 1;
92
93                conn_lock = fsd_mutex_lock( &self->session->drm_connection_mutex );
94
95                /*TODO reconnect */
96                while ( true )
97                 {
98                        switch( action )
99                         {
100                                /*
101                                 * We cannot know whether we did suspend job
102                                 * in other way than remembering this inside DRMAA session.
103                                 */
104                                case DRMAA_CONTROL_SUSPEND:
105                                        apicall = "pbs_sigjob";
106                                        rc = pbs_sigjob( session->pbs_conn, (char*)job_id,
107                                                        "SIGSTOP", NULL );
108                                        fsd_log_info(("pbs_sigjob(%s, SIGSTOP) =%d", job_id, rc));
109                                        if( rc == PBSE_NONE )
110                                                self->flags |= FSD_JOB_SUSPENDED;
111                                        break;
112                                case DRMAA_CONTROL_RESUME:
113                                        apicall = "pbs_sigjob";
114                                        rc = pbs_sigjob( session->pbs_conn, (char*)job_id,
115                                                        "SIGCONT", NULL );
116                                        fsd_log_info(("pbs_sigjob(%s, SIGCONT) =%d", job_id, rc));
117                                        if( rc == PBSE_NONE )
118                                                self->flags &= ~FSD_JOB_SUSPENDED;
119                                        break;
120                                case DRMAA_CONTROL_HOLD:
121                                        apicall = "pbs_holdjob";
122                                        rc = pbs_holdjob( session->pbs_conn, (char*)job_id,
123                                                        USER_HOLD, NULL );
124                                        fsd_log_info(("pbs_sigjob(%s, SIGHOLD) =%d", job_id, rc));
125                                        if( rc == PBSE_NONE )
126                                                self->flags |= FSD_JOB_HOLD;
127                                        break;
128                                case DRMAA_CONTROL_RELEASE:
129                                        apicall = "pbs_rlsjob";
130                                        rc = pbs_rlsjob( session->pbs_conn, (char*)job_id,
131                                                        USER_HOLD, NULL );
132                                        fsd_log_info(("pbs_rlsjob(%s) =%d", job_id, rc));
133                                        if( rc == PBSE_NONE )
134                                                self->flags &= FSD_JOB_HOLD;
135                                        break;
136                                case DRMAA_CONTROL_TERMINATE:
137                                        apicall = "pbs_deljob";
138                                        rc = pbs_deljob( session->pbs_conn, (char*)job_id, NULL );
139                                        fsd_log_info(("pbs_deljob(%s) =%d", job_id, rc));
140                                        /* Torque:
141                                         * deldelay=N -- delay between SIGTERM and SIGKILL (default 0) */
142                                        if( rc == PBSE_NONE )
143                                         {
144                                                self->flags &= FSD_JOB_TERMINATED_MASK;
145                                                if( (self->flags & FSD_JOB_TERMINATED) == 0 )
146                                                        self->flags |= FSD_JOB_TERMINATED | FSD_JOB_ABORTED;
147                                         }
148                                        break;
149                         }
150
151retry_connect:
152                        if ( rc == PBSE_NONE )
153                                break;
154                        else if (( rc == PBSE_INTERNAL || rc == PBSE_PROTOCOL || rc == PBSOLDE_PROTOCOL || rc == PBSE_EXPIRED || rc == PBSOLDE_EXPIRED) && (tries_left--))
155                         {
156                                if (rc == PBSE_PROTOCOL || rc == PBSE_EXPIRED || rc == PBSOLDE_PROTOCOL || rc == PBSOLDE_EXPIRED)
157                                 {
158                                        if ( session->pbs_conn >= 0)
159                                                pbs_disconnect( session->pbs_conn );
160
161                                        sleep( sleep_time++ );
162
163                                        session->pbs_conn = pbs_connect( session->super.contact );
164
165                                        if (session->pbs_conn < 0)
166                                                goto retry_connect;
167
168                                        fsd_log_info(( "pbs_connect(%s) =%d", session->super.contact, session->pbs_conn ));
169                                 }
170                                else /* PBSE_INTERNAL */
171                                 {
172                                        /*
173                                         * In PBS Pro pbs_sigjob raises internal server error (PBSE_INTERNAL)
174                                         * when job just changed its state to running.
175                                         */
176                                        sleep( sleep_time++ );
177                                 }
178                                fsd_log_debug(( "repeating request (%d of %d)", tries_left, session->max_retries_count));
179                         }
180                        else
181                                pbsdrmaa_exc_raise_pbs( apicall );
182                 } /* end while */
183         }
184        FINALLY
185         {
186                if( conn_lock )
187                        conn_lock = fsd_mutex_unlock( &self->session->drm_connection_mutex );
188         }
189        END_TRY
190
191        fsd_log_return((""));
192}
193
194
195void
196pbsdrmaa_job_update_status( fsd_job_t *self )
197{
198        volatile bool conn_lock = false;
199        struct batch_status *volatile status = NULL;
200        pbsdrmaa_session_t *session = (pbsdrmaa_session_t*)self->session;
201        int tries_left = session->max_retries_count;
202        int sleep_time = 1;
203
204        fsd_log_enter(( "({job_id=%s})", self->job_id ));
205       
206        TRY
207         {
208                conn_lock = fsd_mutex_lock( &self->session->drm_connection_mutex );
209retry:
210
211#ifdef PBS_PROFESSIONAL
212                status = pbs_statjob( session->pbs_conn, self->job_id, NULL, NULL );
213#else
214                status = pbs_statjob( session->pbs_conn, self->job_id, session->status_attrl, NULL );
215#endif
216                fsd_log_info(( "pbs_statjob(fd=%d, job_id=%s, attribs={...}) =%p",
217                                 session->pbs_conn, self->job_id, (void*)status ));
218                if( status == NULL )
219                 {
220
221#ifndef PBS_PROFESSIONAL
222                        if ( pbs_errno != PBSE_UNKJOBID )
223                                fsd_log_error(("pbs_statjob error: %d, %s, %s", pbs_errno, pbse_to_txt(pbs_errno), pbs_strerror(pbs_errno)));
224                        else
225                                fsd_log_debug(("pbs_statjob error: %d, %s, %s", pbs_errno, pbse_to_txt(pbs_errno), pbs_strerror(pbs_errno)));
226#else
227#  ifndef PBS_PROFESSIONAL_NO_LOG
228                        if ( pbs_errno != PBSE_UNKJOBID )
229                                fsd_log_error(("pbs_statjob error: %d, %s", pbs_errno, pbse_to_txt(pbs_errno)));
230                        else
231                                fsd_log_debug(("pbs_statjob error: %d, %s", pbs_errno, pbse_to_txt(pbs_errno)));
232#  else
233                        if ( pbs_errno != PBSE_UNKJOBID )
234                                fsd_log_error(("pbs_statjob error: %d", pbs_errno));
235                        else
236                                fsd_log_debug(("pbs_statjob error: %d", pbs_errno));
237#  endif
238#endif
239
240                        switch( pbs_errno )
241                         {
242                                case PBSE_UNKJOBID:
243                                        break;
244                                case PBSE_PROTOCOL:
245#if PBSOLDE_PROTOCOL != PBSE_PROTOCOL
246                                case PBSOLDE_PROTOCOL:
247#endif
248                                case PBSE_EXPIRED:
249#if PBSOLDE_EXPIRED != PBSE_EXPIRED
250                                case PBSOLDE_EXPIRED:
251#endif
252                                        if ( session->pbs_conn >= 0 )
253                                                pbs_disconnect( session->pbs_conn );
254                                        fsd_log_info(("Protocol error. Reconnecting..."));
255retry_connect:
256                                        sleep(sleep_time++);
257                                        session->pbs_conn = pbs_connect( session->super.contact );
258                                        if( session->pbs_conn < 0 )
259                                         {
260                                                if (tries_left--) {
261                                                        fsd_log_info(("%d tries left. Retrying...", tries_left));
262                                                        goto retry_connect;
263                                                } else {
264                                                        fsd_log_error(("No more tries left... Throwing exception"));
265                                                        pbsdrmaa_exc_raise_pbs( "pbs_connect" );
266                                                }
267                                         }
268                                        else
269                                         {
270                                                goto retry;
271                                         }
272                                default:
273                                        pbsdrmaa_exc_raise_pbs( "pbs_statjob" );
274                                        break;
275                                case 0:  /* ? */
276                                        fsd_exc_raise_code( FSD_ERRNO_INTERNAL_ERROR );
277                                        break;
278                         }
279
280                 }
281
282                conn_lock = fsd_mutex_unlock( &self->session->drm_connection_mutex );
283
284
285                if( status != NULL )
286                 {
287                        ((pbsdrmaa_job_t*)self)->update( self, status );
288                 }
289                else if( self->state < DRMAA_PS_DONE )
290                 {
291                        self->on_missing( self );
292                 }
293         }
294        FINALLY
295         {
296                if( conn_lock )
297                        conn_lock = fsd_mutex_unlock( &self->session->drm_connection_mutex );
298                if( status != NULL )
299                        pbs_statfree( status );
300         }
301        END_TRY
302
303        fsd_log_return((""));
304}
305
306
307void
308pbsdrmaa_job_update( fsd_job_t *self, struct batch_status *status )
309{
310        struct attrl *attribs = status->attribs;
311        struct attrl *i = NULL;
312        char pbs_state = 0;
313        int exit_status = -2;
314        const char *cpu_usage = NULL;
315        const char *mem_usage = NULL;
316        const char *vmem_usage = NULL;
317        const char *walltime = NULL;
318        long unsigned int modify_time = 0;
319
320        fsd_log_enter(( "({job_id=%s})", self->job_id ));
321#ifdef DEBUGGING
322        pbsdrmaa_dump_attrl( attribs, NULL );
323#endif
324        fsd_assert( !strcmp( self->job_id, status->name ) );
325
326        for( i = attribs;  i != NULL;  i = i->next )
327         {
328                int attr;
329                attr = pbsdrmaa_pbs_attrib_by_name( i->name );
330                switch( attr )
331                 {
332                        case PBSDRMAA_ATTR_JOB_STATE:
333                                pbs_state = i->value[0];                               
334                                break;
335                        case PBSDRMAA_ATTR_EXIT_STATUS:
336                                exit_status = fsd_atoi( i->value );
337                                break;
338                        case PBSDRMAA_ATTR_RESOURCES_USED:
339                                if( !strcmp( i->resource, "cput" ) )
340                                        cpu_usage = i->value;
341                                else if( !strcmp( i->resource, "mem" ) )
342                                        mem_usage = i->value;
343                                else if( !strcmp( i->resource, "vmem" ) )
344                                        vmem_usage = i->value;
345                                else if( !strcmp( i->resource, "walltime" ) )
346                                        walltime = i->value;
347                                break;
348                        case PBSDRMAA_ATTR_QUEUE:
349                                if (!self->queue)
350                                        self->queue = fsd_strdup(i->value);
351                                break;
352                        case PBSDRMAA_ATTR_ACCOUNT_NAME:
353                                if (!self->project)
354                                        self->project = fsd_strdup(i->value);
355                                break;
356#ifndef PBS_PROFESSIONAL
357                        case PBSDRMAA_ATTR_EXECUTION_HOST:
358                                if (!self->execution_hosts) {
359                                        fsd_log_debug(("execution_hosts = %s", i->value));
360                                        self->execution_hosts = fsd_strdup(i->value);
361                                }
362                                break;
363#else
364                        case PBSDRMAA_ATTR_EXECUTION_VNODE:
365                                if (!self->execution_hosts) {
366                                        fsd_log_debug(("execution_hosts = %s", i->value));
367                                        self->execution_hosts = fsd_strdup(i->value);
368                                }
369                                break;
370#endif
371                        case PBSDRMAA_ATTR_START_TIME:
372                                {
373                                  long unsigned int start_time;
374                                  if (self->start_time == 0 && sscanf(i->value, "%lu", &start_time) == 1)
375                                        self->start_time = start_time;
376                                  break;
377                                }
378                        case PBSDRMAA_ATTR_MTIME:
379                                if (sscanf(i->value, "%lu", &modify_time) != 1)
380                                        modify_time = 0;
381                                break;
382                 }
383         }
384
385        if( pbs_state )
386                fsd_log_debug(( "pbs_state: %c", pbs_state ));
387
388        if( exit_status != -2 )
389         {
390                fsd_log_debug(( "exit_status: %d", exit_status ));
391                self->exit_status = exit_status;
392         }
393        if(pbs_state){
394                switch( pbs_state )
395                 {
396                        case 'C': /* Job is completed after having run. */
397                                self->flags &= FSD_JOB_TERMINATED_MASK;
398                                self->flags |= FSD_JOB_TERMINATED;
399                                if (exit_status != -2) { /* has exit code */
400                                        if( self->exit_status == 0)
401                                                self->state = DRMAA_PS_DONE;
402                                        else
403                                                self->state = DRMAA_PS_FAILED;
404                                } else {
405                                        self->state = DRMAA_PS_FAILED;
406                                        self->exit_status = -1;
407                                }
408                                if (modify_time != 0)
409                                        self->end_time = modify_time; /* take last modify time as end time */
410                                else
411                                        self->end_time = time(NULL);
412                               
413                                if (self->start_time == 0)
414                                        self->start_time = self->end_time;
415
416                                break;
417                        case 'E': /* Job is exiting after having run. - MM: ignore exiting state (transient state) - outputs might have not been transfered yet,
418                                        MM2: mark job as running if current job status is undetermined - fix "ps after job was ripped" */
419                                if (self->state == DRMAA_PS_UNDETERMINED)
420                                        self->state = DRMAA_PS_RUNNING;
421                                break;
422                        case 'H': /* Job is held. */
423                                self->state = DRMAA_PS_USER_ON_HOLD;
424                                self->flags |= FSD_JOB_HOLD;
425                                break;
426                        case 'Q': /* Job is queued, eligible to run or routed. */
427                        case 'W': /* Job is waiting for its execution time to be reached. */
428                                self->state = DRMAA_PS_QUEUED_ACTIVE;
429                                self->flags &= ~FSD_JOB_HOLD;
430                                break;
431                        case 'R': /* Job is running. */
432                        case 'T': /* Job is being moved to new location (?). */
433                         {
434                                if( self->flags & FSD_JOB_SUSPENDED )
435                                        self->state = DRMAA_PS_USER_SUSPENDED;
436                                else
437                                        self->state = DRMAA_PS_RUNNING;
438                                break;
439                         }
440                        case 'S': /* (Unicos only) job is suspend. */
441                                self->state = DRMAA_PS_SYSTEM_SUSPENDED;
442                                break;
443                        case 0:  default:
444                                self->state = DRMAA_PS_UNDETERMINED;
445                                break;
446         }
447}
448        fsd_log_debug(( "job_ps: %s", drmaa_job_ps_to_str(self->state) ));
449
450         {
451                int hours, minutes, seconds;
452                long mem;
453                if( cpu_usage && sscanf( cpu_usage, "%d:%d:%d", &hours, &minutes, &seconds ) == 3 )
454                 {
455                        self->cpu_usage = 60*( 60*hours + minutes ) + seconds;
456                        fsd_log_debug(( "cpu_usage: %s=%lds", cpu_usage, self->cpu_usage ));
457                 }
458                if( mem_usage && sscanf( mem_usage, "%ldkb", &mem ) == 1 )
459                 {
460                        self->mem_usage = 1024*mem;
461                        fsd_log_debug(( "mem_usage: %s=%ldB", mem_usage, self->mem_usage ));
462                 }
463                if( vmem_usage && sscanf( vmem_usage, "%ldkb", &mem ) == 1 )
464                 {
465                        self->vmem_usage = 1024*mem;
466                        fsd_log_debug(( "vmem_usage: %s=%ldB", vmem_usage, self->vmem_usage ));
467                 }
468                if( walltime && sscanf( walltime, "%d:%d:%d", &hours, &minutes, &seconds ) == 3 )
469                 {
470                        self->walltime = 60*( 60*hours + minutes ) + seconds;
471                        fsd_log_debug(( "walltime: %s=%lds", walltime, self->walltime ));
472                 }
473         }
474}
475
476void
477pbsdrmaa_job_on_missing( fsd_job_t *self )
478{
479        pbsdrmaa_session_t *pbssession = (pbsdrmaa_session_t*)self->session;
480        pbsdrmaa_job_t *pbsself = (pbsdrmaa_job_t *)self;
481       
482        if (!pbsself->missing_time)
483         {
484                pbsself->missing_time = time(NULL);
485         }
486
487        fsd_log_info(("pbsdrmaa_job_on_missing: pbs_home=%s, wait_thread_started=%d, submit_time=%d, missing_time=%d",
488                pbssession->pbs_home,
489                pbssession->super.wait_thread_started,
490                (int)self->submit_time,
491                (int)pbsself->missing_time));
492       
493        #define DRMAA_MAX_MISSING_TIME (30)
494        if( pbssession->pbs_home != NULL && pbssession->super.wait_thread_started && self->submit_time && (time(NULL) - pbsself->missing_time < DRMAA_MAX_MISSING_TIME))
495                fsd_log_info(("Job on missing but WT is running. Skipping...")); /* TODO: try to provide implementation that uses accounting/server log files */
496        else
497                pbsdrmaa_job_on_missing_standard( self );       
498}
499
500void
501pbsdrmaa_job_on_missing_standard( fsd_job_t *self )
502{
503        fsd_drmaa_session_t *session = self->session;
504        pbsdrmaa_session_t *pbssession = (pbsdrmaa_session_t *)session;
505        int exit_status = -1;
506       
507        fsd_log_enter(( "({job_id=%s})", self->job_id ));
508        fsd_log_warning(( "Job %s missing from DRM queue", self->job_id ));
509
510        fsd_log_info(( "job_on_missing: last job_ps: %s (0x%02x)", drmaa_job_ps_to_str(self->state), self->state));
511
512        if( (exit_status = pbsdrmaa_job_read_exit_status(self->job_id, pbssession->job_exit_status_file_prefix)) == 0 )
513        {
514                self->state = DRMAA_PS_DONE;
515                self->exit_status = exit_status;
516        }
517        else
518        {
519                self->state = DRMAA_PS_FAILED;
520                self->exit_status = exit_status;
521        }
522        fsd_log_info(("job_on_missing evaluation result: state=%d exit_status=%d", self->state, self->exit_status));
523
524        fsd_cond_broadcast( &self->status_cond);
525        fsd_cond_broadcast( &self->session->wait_condition );
526
527        fsd_log_return(( "; job_ps=%s, exit_status=%d", drmaa_job_ps_to_str(self->state), self->exit_status ));
528}
529
530int
531pbsdrmaa_job_read_exit_status( const char *job_id, const char *job_state_dir_prefix)
532{
533        char *status_file = NULL, *start_file = NULL;
534        FILE *fhandle = NULL;
535        int exit_status = -1;
536
537        fsd_log_enter(("({job_id=%s, job_state_dir_prefix=%s})", job_id, job_state_dir_prefix));
538
539        status_file = fsd_asprintf("%s/%s.exitcode", job_state_dir_prefix, job_id);
540        start_file = fsd_asprintf("%s/%s.started", job_state_dir_prefix, job_id);
541
542        if ((fhandle = fopen(status_file, "r")) == NULL)
543         {
544                struct stat tmpstat;
545
546                fsd_log_error(("Failed to open job status file: %s", status_file));
547                if (stat(start_file, &tmpstat) == 0 && (tmpstat.st_mode & S_IFREG))
548                 {
549                        exit_status = 143; /* SIGTERM */
550                        fsd_log_info(("But start file exist %s. Assuming that job was killed (exit_status=%d).", start_file, exit_status));
551                 }
552                else
553                 {
554                        fsd_log_error(("Start file not found: %s", start_file));
555                 }
556       
557
558         }
559        else
560         {
561                (void)fscanf(fhandle, "%d", &exit_status); /*on error exit_status == -1 */
562                fclose(fhandle);
563         }
564
565        fsd_free(status_file);
566        fsd_free(start_file);
567
568        return exit_status;
569}
570
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.