source: trunk/pbs_drmaa/log_reader.c @ 49

Revision 49, 22.1 KB checked in by mmamonski, 12 years ago (diff)

on site fixies

  • Property svn:keywords set to Id
Line 
1/* $Id$ */
2/*
3 *  FedStage DRMAA for PBS Pro
4 *  Copyright (C) 2006-2007  FedStage Systems
5 *
6 *  This program is free software: you can redistribute it and/or modify
7 *  it under the terms of the GNU General Public License as published by
8 *  the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
9 *  (at your option) any later version.
10 *
11 *  This program is distributed in the hope that it will be useful,
12 *  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
13 *  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
14 *  GNU General Public License for more details.
15 *
16 *  You should have received a copy of the GNU General Public License
17 *  along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
18 */
19
20 #ifdef HAVE_CONFIG_H
21#       include <config.h>
22#endif
23
24#include <stdlib.h>
25#include <ctype.h>
26#include <string.h>
27#include <unistd.h>
28#include <sys/stat.h>
29#include <sys/types.h>
30#include <dirent.h>
31#include <fcntl.h>
32
33#include <pbs_ifl.h>
34#include <pbs_error.h>
35
36#include <drmaa_utils/datetime.h>
37#include <drmaa_utils/drmaa.h>
38#include <drmaa_utils/iter.h>
39#include <drmaa_utils/conf.h>
40#include <drmaa_utils/session.h>
41#include <drmaa_utils/datetime.h>
42
43#include <pbs_drmaa/job.h>
44#include <pbs_drmaa/log_reader.h>
45#include <pbs_drmaa/session.h>
46#include <pbs_drmaa/submit.h>
47#include <pbs_drmaa/util.h>
48#include <pbs_drmaa/pbs_attrib.h>
49
50#include <errno.h>
51
52enum pbsdrmaa_field_id
53{
54        PBSDRMAA_FLD_ID_DATE = 0,
55        PBSDRMAA_FLD_ID_EVENT = 1,
56        PBSDRMAA_FLD_ID_SRC = 2,
57        PBSDRMAA_FLD_ID_OBJ_TYPE = 3,
58        PBSDRMAA_FLD_ID_OBJ_ID = 4,
59        PBSDRMAA_FLD_ID_MSG = 5
60};
61
62
63#define PBSDRMAA_FLD_MSG_0008 "0008"
64#define PBSDRMAA_FLD_MSG_0010 "0010"
65
66enum pbsdrmaa_event_type
67{
68        pbsdrmaa_event_0008 = 8,
69        pbsdrmaa_event_0010 = 10
70};
71
72static void pbsdrmaa_read_log();
73
74static void pbsdrmaa_select_file( pbsdrmaa_log_reader_t * self);
75
76static void pbsdrmaa_close_log( pbsdrmaa_log_reader_t * self);
77
78static void pbsdrmaa_reopen_log( pbsdrmaa_log_reader_t * self);
79
80static time_t pbsdrmaa_parse_log_timestamp(const char *timestamp, char *unixtime_str, size_t size);
81
82static char *pbsdrmaa_get_exec_host_from_accountig(pbsdrmaa_log_reader_t * log_reader, const char *job_id);
83
84/*
85 * Snippets from log files
86 *
87 * PBS Pro
88 *
8910/11/2011 14:43:29;0008;Server@nova;Job;2127218.nova;Job Queued at request of mamonski@endor.wcss.wroc.pl, owner = mamonski@endor.wcss.wroc.pl, job name = STDIN, queue = normal
9010/11/2011 14:43:31;0008;Server@nova;Job;2127218.nova;Job Modified at request of Scheduler@nova.wcss.wroc.pl
9110/11/2011 14:43:31;0008;Server@nova;Job;2127218.nova;Job Run at request of Scheduler@nova.wcss.wroc.pl on exec_vnode (wn698:ncpus=3:mem=2048000kb)+(wn700:ncpus=3:mem=2048000kb)
9210/11/2011 14:43:31;0008;Server@nova;Job;2127218.nova;Job Modified at request of Scheduler@nova.wcss.wroc.pl
9310/11/2011 14:43:32;0010;Server@nova;Job;2127218.nova;Exit_status=0 resources_used.cpupercent=0 resources_used.cput=00:00:00 resources_used.mem=1768kb resources_used.ncpus=6 resources_used.vmem=19228kb resources_used.walltime=00:00:01
94
95 *
96 * Torque
97 *
9810/11/2011 14:47:59;0008;PBS_Server;Job;15545337.batch.grid.cyf-kr.edu.pl;Job Queued at request of plgmamonski@ui.cyf-kr.edu.pl, owner = plgmamonski@ui.cyf-kr.edu.pl, job name = STDIN, queue = l_short
9910/11/2011 14:48:23;0008;PBS_Server;Job;15545337.batch.grid.cyf-kr.edu.pl;Job Run at request of root@batch.grid.cyf-kr.edu.pl
10010/11/2011 14:48:24;0010;PBS_Server;Job;15545337.batch.grid.cyf-kr.edu.pl;Exit_status=0 resources_used.cput=00:00:00 resources_used.mem=720kb resources_used.vmem=13308kb resources_used.walltime=00:00:00
101
102deleting job:
103I . PBS Pro
104a) in Q state
10510/16/2011 09:49:25;0008;Server@grass1;Job;2178.grass1.man.poznan.pl;Job Queued at request of mmamonski@grass1.man.poznan.pl, owner = mmamonski@grass1.man.poznan.pl, job name = STDIN, queue = workq
10610/16/2011 09:49:25;0008;Server@grass1;Job;2178.grass1.man.poznan.pl;Job Modified at request of Scheduler@grass1.man.poznan.pl
10710/16/2011 09:49:37;0008;Server@grass1;Job;2178.grass1.man.poznan.pl;Job to be deleted at request of mmamonski@grass1.man.poznan.pl
10810/16/2011 09:49:37;0100;Server@grass1;Job;2178.grass1.man.poznan.pl;dequeuing from workq, state 5
109
110
111b) in R state
11210/16/2011 09:45:12;0080;Server@grass1;Job;2177.grass1.man.poznan.pl;delete job request received
11310/16/2011 09:45:12;0008;Server@grass1;Job;2177.grass1.man.poznan.pl;Job sent signal TermJob on delete
11410/16/2011 09:45:12;0008;Server@grass1;Job;2177.grass1.man.poznan.pl;Job to be deleted at request of mmamonski@grass1.man.poznan.pl
11510/16/2011 09:45:12;0010;Server@grass1;Job;2177.grass1.man.poznan.pl;Exit_status=271 resources_used.cpupercent=0 resources_used.cput=00:00:00 resources_used.mem=2772kb resources_used.ncpus=1 resources_used.vmem=199288kb resources_used.walltime=00:00:26
11610/16/2011 09:45:12;0100;Server@grass1;Job;2177.grass1.man.poznan.pl;dequeuing from workq, state 5
117
118II. Torque
119a) in Q state
12010/15/2011 21:19:25;0008;PBS_Server;Job;113045.grass1.man.poznan.pl;Job deleted at request of mmamonski@grass1.man.poznan.pl
12110/15/2011 21:19:25;0100;PBS_Server;Job;113045.grass1.man.poznan.pl;dequeuing from batch, state EXITING
122
123b) in R state
12410/15/2011 21:19:47;0008;PBS_Server;Job;113046.grass1.man.poznan.pl;Job deleted at request of mmamonski@grass1.man.poznan.pl
12510/15/2011 21:19:47;0008;PBS_Server;Job;113046.grass1.man.poznan.pl;Job sent signal SIGTERM on delete
12610/15/2011 21:19:47;0010;PBS_Server;Job;113046.grass1.man.poznan.pl;Exit_status=271 resources_used.cput=00:00:00 resources_used.mem=0kb resources_used.vmem=0kb resources_used.walltime=00:00:10
127
128Log closed:
12910/16/2011 00:00:17;0002;PBS_Server;Svr;Log;Log closed
130
131 */
132pbsdrmaa_log_reader_t *
133pbsdrmaa_log_reader_new( fsd_drmaa_session_t *session )
134{
135        pbsdrmaa_log_reader_t *volatile self = NULL;
136
137        fsd_log_enter((""));
138
139        TRY
140        {
141                fsd_malloc(self, pbsdrmaa_log_reader_t );
142               
143                self->session = session;
144
145                self->select_file = pbsdrmaa_select_file;
146                self->read_log = pbsdrmaa_read_log;     
147                self->close = pbsdrmaa_close_log;
148                self->reopen = pbsdrmaa_reopen_log;
149               
150                self->run_flag = true;
151                self->fhandle = NULL;
152                self->date_changed = true;
153                self->first_open = true;
154                self->log_path = NULL;
155                self->current_offset = 0;
156               
157        }
158        EXCEPT_DEFAULT
159        {
160                if( self != NULL)
161                        fsd_free(self);
162                       
163                fsd_exc_reraise();
164        }
165        END_TRY
166
167        fsd_log_return((""));
168
169        return self;
170}
171
172
173void
174pbsdrmaa_log_reader_destroy ( pbsdrmaa_log_reader_t * self )
175{
176        fsd_log_enter((""));
177        TRY
178        {
179                if(self != NULL)
180                {
181                        fsd_free(self);
182                }
183        }
184        EXCEPT_DEFAULT
185        {
186                fsd_exc_reraise();
187        }
188        END_TRY
189       
190        fsd_log_return((""));
191}
192
193
194void
195pbsdrmaa_read_log( pbsdrmaa_log_reader_t * self )
196{
197        fsd_log_enter((""));
198       
199        fsd_mutex_lock( &self->session->mutex );
200
201        TRY
202         {
203                while( self->run_flag )
204                 {
205                        TRY
206                        {
207                                char *line = NULL;
208                               
209                                self->select_file(self);
210
211                                while ((line = fsd_readline(self->fhandle)) != NULL)
212                                 {
213                                        int field_id = PBSDRMAA_FLD_ID_DATE;
214                                        char *tok_ctx = NULL;
215                                        char *field_token = NULL;
216                                        char *event_timestamp = NULL;
217                                        int event_type = -1;
218                                        fsd_job_t *job = NULL;
219
220                                        /* at first detect if this not the end of log file */
221                                        if (strstr(line, "Log;Log closed")) /*TODO try to be more effective and safe */
222                                         {
223                                                fsd_log_debug(("WT - Date changed. Closing log file"));
224                                                self->date_changed = true;
225                                                goto cleanup;
226                                         }
227
228                                        for (field_token = strtok_r(line, ";", &tok_ctx); field_token; field_token = strtok_r(NULL, ";", &tok_ctx), field_id++)
229                                         {
230                                                if ( field_id == PBSDRMAA_FLD_ID_DATE)
231                                                 {
232                                                        event_timestamp = field_token;
233                                                 }
234                                                else if ( field_id == PBSDRMAA_FLD_ID_EVENT)
235                                                 {
236                                                        if (strncmp(field_token, PBSDRMAA_FLD_MSG_0008, 4) == 0)
237                                                                event_type = pbsdrmaa_event_0008;
238                                                        else if (strncmp(field_token, PBSDRMAA_FLD_MSG_0010, 4) == 0)
239                                                                event_type = pbsdrmaa_event_0010;
240                                                        else
241                                                         {
242                                                                goto cleanup; /*we are interested only in the above log messages */
243                                                         }
244                                                 }
245                                                else if ( field_id == PBSDRMAA_FLD_ID_SRC)
246                                                 {
247                                                        /* not used ignore */
248                                                 }
249                                                else if (field_id  == PBSDRMAA_FLD_ID_OBJ_TYPE)
250                                                 {
251                                                        if (strncmp(field_token, "Job", 3) != 0)
252                                                         {
253                                                                goto cleanup; /* we are interested only in job events */
254                                                         }
255                                                 }
256                                                else if (field_id == PBSDRMAA_FLD_ID_OBJ_ID)
257                                                 {
258                                                        const char *event_jobid = field_token;
259                                                       
260                                                        if (!isdigit(event_jobid[0]))
261                                                         {
262                                                                fsd_log_debug(("WT - Invalid job: %s", event_jobid));
263                                                                goto cleanup;
264                                                         }
265
266                                                        job = self->session->get_job( self->session, event_jobid );
267
268                                                        if( job )
269                                                         {
270                                                                fsd_log_debug(("WT - Found job event: %s", event_jobid));
271                                                         }
272                                                        else
273                                                         {
274                                                                fsd_log_debug(("WT - Unknown job: %s", event_jobid)); /* Not a DRMAA job */
275                                                                goto cleanup;
276                                                         }
277                                                 }
278                                                else if (field_id == PBSDRMAA_FLD_ID_MSG)
279                                                 {
280                                                        char *msg = field_token;
281                                                        struct batch_status status;
282                                                        struct attrl *attribs = NULL;
283                                                        bool in_running_state = false;
284
285                                                        if (event_type == pbsdrmaa_event_0008 && strncmp(msg, "Job Queued", 10) == 0)
286                                                         {
287                                                                /* Queued
288                                                                 * PBS Pro: 10/11/2011 14:43:29;0008;Server@nova;Job;2127218.nova;Job Queued at request of mamonski@endor.wcss.wroc.pl, owner = mamonski@endor.wcss.wroc.pl, job name = STDIN, queue = normal
289                                                                 * Torque:  10/11/2011 14:47:59;0008;PBS_Server;Job;15545337.batch.grid.cyf-kr.edu.pl;Job Queued at request of plgmamonski@ui.cyf-kr.edu.pl, owner = plgmamonski@ui.cyf-kr.edu.pl, job name = STDIN, queue = l_short
290                                                                 */
291                                                                char *p_queue = NULL;
292
293                                                                fsd_log_info(("WT - Detected queuing of job %s", job->job_id));
294
295                                                                if ((p_queue = strstr(msg,"queue =")) == NULL)
296                                                                        fsd_exc_raise_fmt(FSD_ERRNO_INTERNAL_ERROR,"No queue attribute found in log line = %s", line);
297
298                                                                attribs = pbsdrmaa_add_attr(attribs, PBSDRMAA_JOB_STATE, "Q");
299                                                                attribs = pbsdrmaa_add_attr(attribs, PBSDRMAA_QUEUE, p_queue + 7);
300                                                         }
301                                                        else if (event_type == pbsdrmaa_event_0008 && strncmp(msg, "Job Run", 7) == 0)
302                                                        {
303                                                                /*
304                                                                 * Running
305                                                                 * Torque: 10/11/2011 14:48:23;0008;PBS_Server;Job;15545337.batch.grid.cyf-kr.edu.pl;Job Run at request of root@batch.grid.cyf-kr.edu.pl
306                                                                 * PBS Pro: 10/11/2011 14:43:31;0008;Server@nova;Job;2127218.nova;Job Run at request of Scheduler@nova.wcss.wroc.pl on exec_vnode (wn698:ncpus=3:mem=2048000kb)+(wn700:ncpus=3:mem=2048000kb)
307                                                                 */
308                                                                char timestamp_unix[64];
309
310                                                                fsd_log_info(("WT - Detected start of job %s", job->job_id));
311
312                                                                (void)pbsdrmaa_parse_log_timestamp(event_timestamp, timestamp_unix, sizeof(timestamp_unix));
313
314                                                                in_running_state = true;
315
316                                                                attribs = pbsdrmaa_add_attr(attribs, PBSDRMAA_JOB_STATE, "R");
317                                                                attribs = pbsdrmaa_add_attr(attribs, PBSDRMAA_START_TIME, timestamp_unix);
318#ifdef PBS_PROFESSIONAL
319                                                                        {
320                                                                                char *p_vnode = NULL;
321                                                                                if ((p_vnode = strstr(msg, "exec_vnode")))
322                                                                                 {
323                                                                                        attribs = pbsdrmaa_add_attr(attribs, PBSDRMAA_EXECUTION_VNODE, p_vnode + 11);
324                                                                                 }
325                                                                        }
326#endif
327                                                         }
328#ifndef PBS_PROFESSIONAL
329                                                        else if (event_type == pbsdrmaa_event_0008 && strncmp(msg, "Job deleted", 11) == 0)
330#else
331                                                        else if (event_type == pbsdrmaa_event_0008 && strncmp(msg, "Job to be deleted", 17) == 0)
332#endif
333                                                         {
334                                                        /* Deleted
335                                                         * PBS Pro: 10/16/2011 09:45:12;0008;Server@grass1;Job;2177.grass1.man.poznan.pl;Job to be deleted at request of mmamonski@grass1.man.poznan.pl
336                                                         * Torque: 10/15/2011 21:19:25;0008;PBS_Server;Job;113045.grass1.man.poznan.pl;Job deleted at request of mmamonski@grass1.man.poznan.pl
337                                                         */
338                                                                char timestamp_unix[64];
339
340                                                                fsd_log_info(("WT - Detected deletion of job %s", job->job_id));
341
342                                                                (void)pbsdrmaa_parse_log_timestamp(event_timestamp, timestamp_unix, sizeof(timestamp_unix));
343
344                                                                if (job->state < DRMAA_PS_RUNNING)
345                                                                 {
346                                                                        fsd_log_info(("WT - Job %s killed before entering running state (%d).", job->job_id, job->state));
347                                                                        attribs = pbsdrmaa_add_attr(attribs, PBSDRMAA_JOB_STATE, "C");
348                                                                        attribs = pbsdrmaa_add_attr(attribs, PBSDRMAA_MTIME, timestamp_unix);
349                                                                        attribs = pbsdrmaa_add_attr(attribs, PBSDRMAA_EXIT_STATUS, "-2");
350                                                                 }
351                                                                else
352                                                                 {
353                                                                        fsd_log_info(("WT - Job %s killed after entering running state (%d). Waiting for Completed event...", job->job_id, job->state));
354                                                                        goto cleanup; /* job was started, ignore, wait for Exit_status message */
355                                                                 }
356                                                         }
357                                                        else if (event_type == pbsdrmaa_event_0010 && (strncmp(msg, "Exit_status=", 12) == 0))
358                                                         {
359                                                        /* Completed:
360                                                         * PBS Pro: 10/11/2011 14:43:32;0010;Server@nova;Job;2127218.nova;Exit_status=0 resources_used.cpupercent=0 resources_used.cput=00:00:00 resources_used.mem=1768kb resources_used.ncpus=6 resources_used.vmem=19228kb resources_used.walltime=00:00:01
361                                                         * Torque: 10/11/2011 14:48:24;0010;PBS_Server;Job;15545337.batch.grid.cyf-kr.edu.pl;Exit_status=0 resources_used.cput=00:00:00 resources_used.mem=720kb resources_used.vmem=13308kb resources_used.walltime=00:00:00
362                                                         */
363                                                                char timestamp_unix[64];
364                                                                time_t timestamp_time_t = pbsdrmaa_parse_log_timestamp(event_timestamp, timestamp_unix, sizeof(timestamp_unix));
365                                                                char *tok_ctx2 = NULL;
366                                                                char *token = NULL;
367
368                                                                attribs = pbsdrmaa_add_attr(attribs, PBSDRMAA_JOB_STATE, "C");
369                                                                attribs = pbsdrmaa_add_attr(attribs, PBSDRMAA_MTIME, timestamp_unix);
370
371                                                                /* tokenize !!! */
372                                                                for (token = strtok_r(msg, " ", &tok_ctx2); token; token = strtok_r(NULL, " ", &tok_ctx2))
373                                                                 {
374                                                                        if (strncmp(token, "Exit_status=", 12) == 0)
375                                                                         {
376                                                                                token[11] = '\0';
377                                                                                attribs = pbsdrmaa_add_attr(attribs, PBSDRMAA_EXIT_STATUS, token + 12);
378                                                                                fsd_log_info(("WT - Completion of job %s (Exit_status=%s) detected after %d seconds", job->job_id, token+12, (int)(time(NULL) - timestamp_time_t) ));
379                                                                         }
380                                                                        else if (strncmp(token, "resources_used.cput=", 20) == 0)
381                                                                         {
382                                                                                token[19] = '\0';
383                                                                                attribs = pbsdrmaa_add_attr(attribs, token, token + 20);
384                                                                         }
385                                                                        else if (strncmp(token, "resources_used.mem=", 19) == 0)
386                                                                         {
387                                                                                token[18] = '\0';
388                                                                                attribs = pbsdrmaa_add_attr(attribs, token, token + 19);
389                                                                         }
390                                                                        else if (strncmp(token, "resources_used.vmem=", 20) == 0)
391                                                                         {
392                                                                                token[19] = '\0';
393                                                                                attribs = pbsdrmaa_add_attr(attribs, token, token + 20);
394                                                                         }
395                                                                        else if (strncmp(token, "resources_used.walltime=", 24) == 0)
396                                                                         {
397                                                                                token[23] = '\0';
398                                                                                attribs = pbsdrmaa_add_attr(attribs, token, token + 24);
399                                                                         }
400                                                                 }
401
402                                                                if (!job->execution_hosts)
403                                                                 {
404                                                                        char *exec_host = NULL;
405                                                                        fsd_log_info(("WT - No execution host information for job %s. Reading accounting logs...", job->job_id));
406                                                                        exec_host = pbsdrmaa_get_exec_host_from_accountig(self, job->job_id);
407                                                                        if (exec_host)
408                                                                         {
409                                                                                attribs = pbsdrmaa_add_attr(attribs, PBSDRMAA_EXECUTION_HOST, exec_host);
410                                                                                fsd_free(exec_host);
411                                                                         }
412                                                                 }
413                                                         }
414                                                        else
415                                                        {
416                                                                fsd_log_debug(("Ignoring msg(type=%d) = %s", event_type,  msg));
417                                                                goto cleanup; /* ignore other job events*/
418                                                        }
419                                       
420                                                        fsd_log_debug(("WT - updating job: %s", job->job_id ));
421                                                        status.name = job->job_id;
422                                                        status.attribs = attribs;
423
424                                                        ((pbsdrmaa_job_t *)job)->update( job, &status );
425
426                                                        if ( in_running_state )
427                                                         {
428                                                                fsd_log_debug(("WT - forcing update of job: %s", job->job_id ));
429                                                                TRY
430                                                                {
431                                                                        job->update_status( job );
432                                                                }
433                                                                EXCEPT_DEFAULT
434                                                                {
435                                                                        /*TODO: distinguish between invalid job and internal errors */
436                                                                        fsd_log_debug(("Job finished just after entering running state: %s", job->job_id));
437                                                                }
438                                                                END_TRY
439                                                         }
440
441
442                                                        pbsdrmaa_free_attrl(attribs); /* TODO free on exception */
443
444                                                        fsd_cond_broadcast( &job->status_cond);
445                                                        fsd_cond_broadcast( &self->session->wait_condition );
446
447                                                 }
448                                                else
449                                                 {
450                                                        fsd_assert(0); /*not reached */
451                                                 }
452                                         }
453                                cleanup:
454                                        fsd_free(line); /* TODO what about exceptions */               
455                                        if ( job )
456                                                job->release( job );
457
458
459
460                                 } /* end of while getline loop */
461
462
463
464                                fsd_mutex_unlock( &self->session->mutex );
465
466                                /* close */
467                                self->close(self);
468
469                                sleep(((pbsdrmaa_session_t *)self->session)->wait_thread_sleep_time);
470
471                                /* and reopen log file */
472                                self->reopen(self);
473
474                                fsd_mutex_lock( &self->session->mutex );
475
476                                self->run_flag = self->session->wait_thread_run_flag;
477                        }
478                        EXCEPT_DEFAULT
479                        {
480                                const fsd_exc_t *e = fsd_exc_get();
481                                /* Its better to exit and communicate error rather then let the application to hang */
482                                fsd_log_fatal(( "Exception in wait thread: <%d:%s>. Exiting !!!", e->code(e), e->message(e) ));
483                                exit(1);
484                        }
485                        END_TRY
486                 }
487
488                if(self->fhandle)
489                        fclose(self->fhandle);
490
491                fsd_log_debug(("WT - Log file closed"));
492        }
493        FINALLY
494        {
495                fsd_log_debug(("WT - Terminated."));
496                fsd_mutex_unlock( &self->session->mutex ); /**/
497        }
498        END_TRY
499       
500        fsd_log_return((""));
501}
502
503void
504pbsdrmaa_select_file( pbsdrmaa_log_reader_t * self )
505{
506        pbsdrmaa_session_t *pbssession = (pbsdrmaa_session_t*) self->session;
507       
508        if (self->date_changed)
509         {
510                int num_tries = 0;
511                struct tm tm;
512               
513                fsd_log_enter((""));
514               
515                if(!self->first_open)
516                        time(&self->t);
517                else
518                        self->t = pbssession->log_file_initial_time;
519                       
520                localtime_r(&self->t,&tm);
521                               
522                #define DRMAA_WAIT_THREAD_MAX_TRIES (12)
523                /* generate new date, close file and open new */
524                if (self->log_path)
525                        fsd_free(self->log_path);
526
527                self->log_path = fsd_asprintf("%s/server_logs/%04d%02d%02d", pbssession->pbs_home, tm.tm_year + 1900, tm.tm_mon + 1, tm.tm_mday);
528
529                if(self->fhandle)
530                        fclose(self->fhandle);
531
532                fsd_log_info(("Opening log file: %s",self->log_path));
533                               
534        retry:
535                if ((self->fhandle = fopen(self->log_path,"r")) == NULL && (num_tries > DRMAA_WAIT_THREAD_MAX_TRIES || self->first_open))
536                 {
537                        fsd_log_error(("Can't open log file: %s. Verify pbs_home. Running standard wait_thread.", self->log_path));
538                        fsd_log_error(("Remember that without keep_completed set the standard wait_thread won't provide information about job exit status"));
539                        /*pbssession->super.enable_wait_thread = false;*/ /* run not wait_thread */
540                        pbssession->wait_thread_log = false;
541                        pbssession->super.wait_thread = pbssession->super_wait_thread;
542                        pbssession->super.wait_thread(self->session);
543                 }
544                else if ( self->fhandle == NULL )
545                 { /* Torque seems not to create a new file immediately after the old one is closed */
546                        fsd_log_warning(("Can't open log file: %s. Retries count: %d", self->log_path, num_tries));
547                        num_tries++;
548                        sleep(2 * num_tries);
549                        goto retry;
550                 }
551
552                fsd_log_debug(("Log file opened"));
553
554                if(self->first_open)
555                 {
556                        fsd_log_debug(("Log file lseek"));
557
558                        if(fseek(self->fhandle, pbssession->log_file_initial_size, SEEK_SET) == (off_t) -1)
559                         {
560                                fsd_exc_raise_fmt(FSD_ERRNO_INTERNAL_ERROR,"fseek error");
561                         }
562                        self->first_open = false;
563                 }
564
565                self->date_changed = false;
566               
567                fsd_log_return((""));
568        }       
569}
570
571time_t
572pbsdrmaa_parse_log_timestamp(const char *timestamp, char *unixtime_str, size_t size)
573{
574        struct tm temp_time_tm;
575        memset(&temp_time_tm, 0, sizeof(temp_time_tm));
576        temp_time_tm.tm_isdst = -1;
577
578        if (strptime(timestamp, "%m/%d/%Y %H:%M:%S", &temp_time_tm) == NULL)
579         {
580                fsd_exc_raise_fmt(FSD_ERRNO_INTERNAL_ERROR,"WT - failed to parse log timestamp: %s", timestamp);
581         }
582        else
583         {
584                time_t temp_time = mktime(&temp_time_tm);
585                snprintf(unixtime_str, size, "%lu", temp_time);
586                return temp_time;
587         }
588}
589
590char *
591pbsdrmaa_get_exec_host_from_accountig(pbsdrmaa_log_reader_t * log_reader, const char *job_id)
592{
593                pbsdrmaa_session_t *pbssession = (pbsdrmaa_session_t*) log_reader->session;
594                struct tm tm;
595                time_t tm_t;
596                char *line = NULL;
597                char *exec_host = NULL;
598                char *log_path = NULL;
599                FILE *fhandle = NULL;
600
601                fsd_log_enter(("(job_id=%s)", job_id));
602
603                tm_t = time(NULL);
604                localtime_r(&tm_t, &tm);
605
606                log_path = fsd_asprintf("%s/server_priv/accounting/%04d%02d%02d", pbssession->pbs_home, tm.tm_year + 1900, tm.tm_mon + 1, tm.tm_mday);
607
608                fsd_log_info(("Opening accounting log file: %s", log_path));
609
610                if ((fhandle = fopen(log_path, "r")) == NULL)
611                 {
612                        fsd_log_error(("Failed to open accounting log file: %s", log_path));
613                        fsd_free(log_path);
614                        return NULL;
615                 }
616
617                fsd_free(log_path);
618/*
61910/27/2011 14:09:32;E;114249.grass1.man.poznan.pl;user=drmaa group=drmaa jobname=none queue=shortq ctime=1319717371 qtime=1319717371 etime=1319717371 start=1319717372 owner=drmaa@grass1.man.poznan.pl exec_host=grass4.man.poznan.pl/0 Resource_List.neednodes=1 Resource_List.nodect=1 Resource_List.nodes=1 Resource_List.walltime=02:00:00 session=28561 end=1319717372 Exit_status=0 resources_used.cput=00:00:00 resources_used.mem=0kb resources_used.vmem=0kb resources_used.walltime=00:00:00
620 */
621                while ((line = fsd_readline(fhandle)) != NULL)
622                 {
623
624                        if (line[20] == 'E'  && strncmp(line + 22, job_id, strlen(job_id)) == 0 )
625                         {
626                                char *p = NULL;
627
628                                fsd_log_debug(("Matched accounting log record = %s", line));
629
630                                if (!(exec_host = strstr(line, "exec_host")))
631                                 {
632                                        fsd_log_error(("Invalid accounting record: %s", exec_host));
633                                        break;
634                                 }
635
636                                exec_host += 10;
637
638                                p = exec_host;
639                                while (*p != ' ' && *p != '\0')
640                                        p++;
641                                *p = '\0';
642
643                                break;
644                         }
645
646                        fsd_free(line);
647                 }
648
649                if (exec_host)
650                 {
651                        fsd_log_info(("Job %s was executing on hosts %s.", job_id, exec_host));
652                        exec_host = fsd_strdup(exec_host);
653                 }
654                else
655                 {
656                        fsd_log_error(("Could not find executions hosts for %s.", job_id));
657                 }
658
659                if (line)
660                        fsd_free(line);
661
662                fclose(fhandle);
663
664                return exec_host;
665}
666
667void
668pbsdrmaa_close_log( pbsdrmaa_log_reader_t * self )
669{
670
671        self->current_offset = ftello(self->fhandle);
672       
673        fsd_log_debug(("Closing log  file (offset=%d)", self->current_offset)); 
674
675        fclose(self->fhandle);
676
677        self->fhandle = NULL;
678}
679
680void
681pbsdrmaa_reopen_log( pbsdrmaa_log_reader_t * self )
682{
683        fsd_log_debug(("Reopening log file: %s (offset=%d)", self->log_path, self->current_offset)); 
684
685        if ((self->fhandle = fopen(self->log_path,"r")) == NULL)
686         {
687                fsd_exc_raise_fmt(FSD_ERRNO_INTERNAL_ERROR,"Failed to reopen log file");
688         }
689
690        if(fseek(self->fhandle, self->current_offset, SEEK_SET) == (off_t) -1)
691         {
692                fsd_exc_raise_fmt(FSD_ERRNO_INTERNAL_ERROR,"fseek error");
693         }
694}
695
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.