Changes between Version 22 and Version 23 of Gaussian
- Timestamp:
- 05/27/14 10:36:37 (10 years ago)
Legend:
- Unmodified
- Added
- Removed
- Modified
-
Gaussian
v22 v23 11 11 * W przypadku nie podania dyrektywy `%chk` jest ona automatycznie dodawana na podstawie nazwy pliku wejściowego, 12 12 * Podobnie: dyrektywy %mem oraz %nproc są automatycznie ustawiane w pliku wejściowym na podstawie wymagań podanych przy zlecaniu zadania. W przypadku pamięci należy do wymagań dodać 1024MB na potrzeby samego środowiska Gaussian. 13 * Aplikację Gaussian należy zlecać jako aplikację równoległą typu: "Równoległa z topologią".13 * Aplikację Gaussian należy zlecać jako aplikację równoległą. 14 14 == Przykład użycia == 15 15 * Aby zlecić symulację należy dwukrotnie kliknąć plik wejściowy (Windows) lub wybrać akcję `zleć zadanie` z menu plik, … … 18 18 * Następnie należy ustawić maksymalny czas wykownywania w godzinach (najdłuższa kolejka w PL-Gridzie jest w stanie przyjąć zadania o `walltime` 168h) 19 19 * Innym istotnym parametrem zadania jest wymaganie pamięci. Na podstawie tego wymagania zostanie automatycznie dodana dyrektywa `%mem`, pomniejszona o wartość 1024MB. Przykład: Jeżeli podamy w wymaganiach limit pamięci równy `8G` to do pliku z opisem zostanie dodana automatycznie dyrektywa: `%mem=7168MB` (8G - 1024MB = (8 * 1024MB) - 1024MB = 7168MB), 20 * Definujemy aplikację jako **`Równoległą z topologią`** i ewentualnie zmieniamy liczbę rdzeni na węzeł (podawanie wartości większej niż 4-6 w przypadku większości układów nie ma sensu, może wręcz spowolnić obliczenia). Liczba węzłow powinna być zawsze ustawiona na `1`. W przeciwnym wypadku zadanie zakończy się błędem z następującym komunikatem w pliku logu "QCG-ERROR: Gaussian can be run only on single node! Use %QCG nodes=1:X (commandline client) or parallell with topology(QCG-Icon)".20 * Definujemy aplikację jako **`Równoległą`** i ewentualnie zmieniamy liczbę rdzeni na węzeł (podawanie wartości większej niż 4-6 w przypadku większości układów nie ma sensu, może wręcz spowolnić obliczenia). Liczba węzłow powinna być zawsze ustawiona na `1`. W przeciwnym wypadku zadanie zakończy się błędem z następującym komunikatem w pliku logu "QCG-ERROR: Gaussian can be run only on single node! Use %QCG nodes=1:X (commandline client) or parallell (QCG-Icon)". 21 21 * Kilkamy na `zleć zadanie`, 22 22 * Po uruchomieniu zadania możemy na bieżąco obserwować przebieg symulacji kilkając dwa razy na wiersz z zadaniem. Okno podglądu ma funkcjonalność filtrowania (zbliżoną do Linuksowego polecenia grep).