Version 8 (modified by mmamonski, 12 years ago) (diff) |
---|
Gaussian
Skonfigurowane wersje
- gaussian/g09.c.01 (Galera+, Zeus)
- gaussian/g09.a.02 (Hydra, Reef)
- guassian/g09.b.01 (Nova, Inula)
Uwagi ogólne
- Aplikacja QCG-Icon troszczy się o automatyczne ustawienie dyrektyw %rwf w zależności od klastra na które zostało zlecone zadanie,
- W przypadku nie podania dyrektywy %chk jest ona automatycznie dodawana na podstawie nazwy pliku wejściowego,
- Podobnie: dyrektywy %mem oraz %nproc są automatycznie ustawiane w pliku wejściowym na podstawie wymagań podanych przy zlecaniu zadania. W przypadku pamięci należy do wymagań dodać 512MB na potrzeby samego środowiska Gaussian.
- Aplikację Gaussian należy zlecać jako aplikację równoległą typu: "Równoległa z topologią".
Przykład użycia =
*
Uwagi dotyczące klastrów
Ze względu na duży rozmiar, oraz częste operacje zapisu oraz odczytu, plików tymczasowych aplikacji Gaussian (*.rwf) najkorzystniej jest zlecać zadania tego typu na klastry wyposażone w szybkie, współdzielone, przestrzenie dyskowe na dane tymczasowe (tzw. Scratch). Są to obecnie klastry:
- Zeus (Cyfronet),
- Reef (PCSS),
- Inula (PCSS),
- Nova (WCSS).
Dla pozostałych klastrów limity na maksymalną wielkość pliku RWF pojedynczego zadania wynoszą odpowiednio (wartości przybliżone):
- Galera (TASK) - 2GB,
- Hydra (ICM) - 50GB.
Narzędzia dodatkowe
- Narzędzie integrujące program Gaussview z QCG-Icon: gv-qcg.exe ( instrukcja)
- skrypt do generowania formatowanych plików checkpoint: